Esta situado en el corazón del llamado Triángulo de Coral, el cual está delimitado por los arrecifes del norte de Australia, Indonesia y Filipinas. Dada su privilegiada ubicación conjuga lo mejor de Indonesia, Filipinas y Papúa Nueva Guinea.
El archipiélago esta formado por mas de 1.500 islotes que rodean a las cuatro islas principales: Misool, Salawati, Batanta y Waigeo.
Hasta hace muy poco tiempo, nadie conocía este remoto lugar hasta que la prestigiosa revista Nature difundió su mas reciente y exitoso descubrimiento: Raja Ampat alberga la mayor biodiversidad del planeta.
A día de hoy, las islas de Raja Ampat siguen siendo terreno prácticamente inexplorado.